無可簡化的複雜基因組：打從一開始，就是設計的
張逸萍譯自﹕“The Irreducibly Complex Genome: Designed from the Beginning”
BY JEFFREY P. TOMKINS, PH.D. , FEBRUARY 29, 2012
（https://www.icr.org/article/irreducibly-complex-genome-designed）
約在 35
年前第一個病毒基因被定序以來，現代基因組（Genome）學時代便開啟了，基因的組成和運作方式的概念，發生了顯著變化。1 此後，微生物、植物和動物的整個基因組都已被定序。
當人們開始研究基因功能時，普遍認為基因與其
RNA 和蛋白質產物之間，存在著一一對應的關係。然而，基因組定序工作很快就發現，所發現的
RNA 和相應的蛋白質的數量，比 DNA
序列中發現的基因數量多幾百倍。我們現在知道，這是由於與基因功能相關的許多複雜機製造成的。在動植物中，一個基因通常會從基因區域的多個DNA片段產生一個信使RNA（messenger
RNA），即轉錄本（transcript）。這些編碼片段稱為外顯子（exon），而非編碼的片段（內含子，intron），在
RNA
加工過程中會被剪除。單一基因區域可以透過添加、倍增或消除外顯子產生多種轉錄本，這個過程稱為選擇性剪接（見圖 1）。例如，人類的三個神經連接蛋白基因可以產生超過
3000
種不同的轉錄本。2
本文作者目前正在總結基因功能領域的世俗研究的關鍵點，以撰寫一篇文獻綜述，準備發表在期刊上，以證明基因功能的不可簡化的複雜性。該計畫將表明，基因組進化的概念過於簡單化，忽略了短短幾十年的基因組學研究所揭示的巨大複雜性。
簡而言之，現在已知基因功能涉及：1）位於基因區域各處的多種調控DNA序列，這些序列發揮作用，控制特徵；
2）基因與基因網絡之間複雜的相互聯繫，3）三維染色體結構的動態調控，
4) DNA
化學性質和構造特徵的相互作用，5)
細胞組織類型和生理狀態，以及 6)
基因庫內 DNA
序列變異的影響。甚至這些類別還可以再細分為更細的研究領域。
科學家曾試圖推斷許多基因的預測性剪接密碼。3,4
由於位於完全不同染色體上的基因之間存在選擇性剪接，這項工作變得複雜起來。4 為了實現這一點，基因組不同區域的基因會動態地彼此緊密相鄰，並在高度複雜的基因工廠區域中轉錄。3 上述六大機制類別，均在基因功能的這層面有份，從而構成了難以理解的生物複雜性的虛擬交響曲。
我們對智慧設計的基因組的認識不斷加深，徹底否定了基因組透過自然過程進化的概念。基因組是一個極其複雜的系統，從一開始就被設計和實現，每個被造物種都具有其獨特的特性，正如《創世記》中所記載的那樣。
參考
1.
See Sherwin, F. 2011. So,
What Is a Gene? Acts & Facts. 40
(10): 16.
2.
U of T researchers crack “splicing code,” solve a mystery
underlying biological complexity. University of Toronto
news release, May 5, 2010.
3.
Barash, Y. et al. 2010. Deciphering the splicing
code. Nature. 465 (7294): 53-59.
4.
Horiuchi, T. and T. Aigaki. 2006. Alternative
trans-splicing: a novel mode of pre-mRNA processing. Biology of the
Cell. 98 (2): 135-140.
* Dr. Tomkins is Research Associate at the
Institute for Creation Research and received his Ph.D. in Genetics from
Clemson University.
Cite this article: Tomkins, J. 2012. The
Irreducibly Complex Genome: Designed from the Beginning. Acts & Facts.
41 (3): 6.